สุนัขบ้านมีสีและลวดลายขน ที่ หลากหลาย ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมหลายชนิด รูปแบบสีที่แตกต่างกันเป็นผลมาจากการควบคุมของยีน Agoutiซึ่งอาจทำให้รูขุมขนเปลี่ยนจากการสร้างเม็ดสีสีดำหรือสีน้ำตาลเป็นสีเหลืองหรือเกือบเป็นสีขาว รูปแบบขนที่พบบ่อยที่สุดในหมาป่ายุคใหม่คือหนูชนิดหนึ่งซึ่งส่วนบนของลำตัวมีขนเป็นแถบและด้านล่างมีเงาสีอ่อนกว่า สีเหลืองเด่นกว่าสีดำและพบได้ในสุนัขทั่วโลกและสุนัขดิงโกในออสเตรเลีย ในปี 2021 การศึกษาลำดับจีโนมทั้งหมดที่นำมาจากสุนัขและหมาป่ามุ่งเน้นไปที่ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างพวกมันตามสี ขนสุนัข การศึกษาพบว่าhaplotypes สีของสุนัขส่วนใหญ่ มีความคล้ายคลึงกับ haplotypes ของหมาป่าส่วนใหญ่ อย่างไรก็ตาม สีเหลืองที่โดดเด่นในสุนัขนั้นสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับสีขาวในหมาป่าอาร์กติกจากอเมริกาเหนือ ผลลัพธ์นี้ชี้ให้เห็นจุดกำเนิดทั่วไปของสีเหลืองเด่นในสุนัขและสีขาวในหมาป่า แต่ไม่มีการไหลของยีนเมื่อเร็วๆ นี้ เนื่องจากพบว่า clade นี้มีพื้นฐานทางพันธุกรรมมาจากสุนัขจิ้งจอกสีทองและมีลักษณะทางพันธุกรรมที่แตกต่างจากสุนัข canids อื่นๆ ทั้งหมด บรรพบุรุษร่วมล่าสุดของสุนัขจิ้งจอกสีทองและสายเลือดหมาป่ามีอายุย้อนกลับไปเมื่อ 2 ล้านปีที่แล้ว