การศึกษาตัวนิ่มเผยให้เห็นสายพันธุ์ใหม่ของไวรัสโคโรนาและทำให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับแหล่งกำเนิด ภูมิภาคต่างๆ ของโลกประสบกับการระบาดของไวรัสที่เกิดจากไวรัสโคโรนา ที่ทำให้เกิดโรคในมนุษย์ (CoVs) ซึ่งส่งผลให้เกิดโรคระบาดและการระบาดใหญ่ เมื่อไม่นานมานี้ ไวรัสโคโรนากลุ่มอาการทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรง 2 (SARS-CoV-2) สล็อต ทำให้เกิดการแพร่ระบาดของโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (COVID-19) อย่างต่อเนื่อง ในขณะที่ไวรัสโคโรนากลุ่มอาการทางเดินหายใจตะวันออกกลาง (MERS-CoV) เป็นสาเหตุให้เกิดการระบาดของโรคเมอร์ส

การแพร่ระบาดจากสัตว์สู่คนเป็นสาเหตุของการเกิดไวรัสชนิดใหม่ ดังที่แสดงให้เห็นโดย MERS-CoV ซึ่งติดต่อจากอูฐสู่มนุษย์ ค้างคาวถือเป็นแหล่งกักเก็บธรรมชาติของทั้ง SARS-CoVs และ MERS-CoVs

มีสองสมมติฐานเกี่ยวกับที่มาของ SARS-CoV-2 โดยข้อแรกระบุว่าไวรัสรั่วไหลออกจากสัตว์ที่ตลาดอาหารทะเลในเมืองอู่ฮั่น ประเทศจีน สมมติฐานที่สองคือการปล่อยไวรัสโดยบังเอิญจากห้องทดลองในอู่ฮั่นที่ทำการวิจัย CoVs ที่เกี่ยวข้องกับโรคซาร์สCoVs ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 อยู่ในสกุล betacoronavirus ของ coronaviruses และ Merbecovirus subgenus MERS-CoV และ HKU4-CoV ใช้ตัวรับ dipeptidyl peptidase 4 (DPP4) ของเซลล์โฮสต์สำหรับการบุกรุกจีโนมบางส่วนที่เกี่ยวข้องกับ SARS-CoV-2 ได้รับการระบุในชุดข้อมูลการจัดลำดับเนื้อเยื่อตัวลิ่นเมื่อปลายปี 2019 สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับ SARS-CoV-2 สองสายพันธุ์ ได้แก่ Guangdong (GD) และ Guangxi (GX) ถูกระบุในตัวอย่างเนื้อเยื่อตัวลิ่นหลังจาก การระบาดของโควิด 19Forensics And Toxicology eBook รวบรวมบทสัมภาษณ์ บทความ และข่าวสารชั้นนำในปีที่ผ่านมา

ไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ GD pangolin มีความคล้ายคลึงกัน 97% กับโดเมนการจับตัวรับ (RBD) ของ SARS-CoV-2 นอกจากนี้ ความสัมพันธ์ในการจับที่สูงกว่าสิบเท่าของ CoV (PCoV) ที่เกี่ยวข้องกับ GD pangolin สำหรับ  ตัวรับ เอนไซม์ที่เปลี่ยน angiotensin ของมนุษย์ 2  ( ACE2 ) ถูกสังเกตเมื่อเปรียบเทียบกับตัว pangolin ACE2GX pangolin coronaviruses ถูกตรวจพบครั้งแรกในตัวอย่างเนื้อเยื่อของ Malayan pangolin ( Manis javanica ) ทั้ง GD และ GX ดูเหมือนจะหายาก โดยไม่พบการติดเชื้อในป่า 

CoVs ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 รวมถึง MjHKU4r-CoV-1 และสายพันธุ์ต่างๆ นั้น ถูกระบุในลิ่นสี่ตัวจากทั้งหมดแปดสิบหกตัวที่ศุลกากรกว่างซียึดได้ แม้ว่าลิ่นจะถูกพิจารณาว่ามีความไวต่ำต่อ CoV ที่เกี่ยวข้องกับโรคซาร์ส แต่เซลล์ส่วนปลายของท่อไตของพวกมันก็อนุมานถึงความอ่อนแอได้

เกี่ยวกับการศึกษาการศึกษาในปัจจุบันระบุ HKU4r-BGI-2020 CoV นวนิยายจากชุดข้อมูลการจัดลำดับกรดไรโบนิวคลีอิกเซลล์เดียวเจ็ดตัวลิ่น (RNA-Seq) ในเชิงวิวัฒนาการ HKU4-BGI-2020 อยู่ใน clade b ซึ่งประกอบด้วย pangolin coronaviruses MjHKU4r-CoV-1, PCoV HKU4-P251T และ Tylonycteris robustula  bat  CoV 162275 ที่ระดับจีโนมเต็ม เช่นเดียวกับ RNA-dependent RNA polymerase (RdRp ) และยีนสไปค์ (S) และนิวคลีโอแคปซิด (N) HKU4r-BGI-2020 แสดงความคล้ายคลึงของนิวคลีโอไทด์ 97.34% กับ MjHKU4r-CoV-1 ซึ่งเป็นไวรัสโคโรนาที่เพิ่งตรวจพบซึ่งเกี่ยวข้องกับตัวลิ่น ความคล้ายคลึง 97.23% กับ HKU4-P251T และความคล้ายคลึงของนิวคลีโอไทด์ 92.86% กับค้างคาว Tylonycteris robustula CoV ที่  แยก  ได้ ตรวจพบ MjHKU4r-CoV-1, MjHKU4r-CoV-2, MjHKU4r-CoV-3 และ MjHKU4rCoV-4 ในชุดข้อมูล Next-Generation Sequencing (NGS) สี่ชุดที่สร้างจากตัวลิ่น Manis javanica ที่ยึดโดยศุลกากรกว่า  ง  ซี

ที่น่าสนใจคือ การค้นพบ CoV ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 บางส่วนที่มีความคล้ายคลึงกัน 97.48% กับ PCoV HKU4-P251T มีการอ่านที่ตรงกันเพียง 25 ครั้งในชุดข้อมูล NGS เนื่องจากจำนวนการอ่านต่ำ จึงไม่ชัดเจนว่า CoV เกิดจากการปนเปื้อนโดยไม่ได้ตั้งใจหรือไม่

ชุดข้อมูล NGS ที่พัฒนาจากตัวอย่าง HKU4-GX, PPeV-GX และ GX19-89 ใน BioProject PRJNA901878 เกือบทั้งหมดประกอบด้วย   เนื้อหาจีโนมของ  Sus scrofa และไม่ใช่ของ M. javanica  หรือ  Rhizomys pruinosusเมื่อพิจารณาจากสิ่งที่ค้นพบ มันไม่น่าเชื่อถือเลยที่ CoV ที่ระบุนั้นเกี่ยวข้องกับ   ตัวอย่างM. javanica

ตามจีโนมิกส์ทางนิติวิทยาศาสตร์ อัตราส่วนของไวรัสต่อค่าที่สัตว์อ่านได้สามารถนำมาใช้เพื่อยืนยันว่าสัตว์ชนิดใดเป็นตัวการที่มีแนวโน้มว่าจะเป็นเจ้าบ้านหรือไม่ การมีอยู่ของ Pangolin hunnivirus แยก GX/HKU4-GX/2020 ใน  ชุดข้อมูล S. scrofa  NGS และความคล้ายคลึงกับ pangolin CoV MjHKU4r-CoV-1 บ่งชี้ว่าพวกมันเกี่ยวข้องกับการวิจัยในห้องปฏิบัติการ

ประมาณ 98% ของการอ่านที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 พบในชุดข้อมูล RNA-Seq นิวเคลียสเซลล์เดียวในลำไส้ใหญ่ พบความสัมพันธ์ในระดับปานกลางโดยรวมระหว่างปริมาณแบคทีเรียและปริมาณไวรัสที่อ่านได้ ชุดข้อมูลตัวอย่างกระเพาะอาหาร ปอด ตับและลำไส้เล็กส่วนต้นยังแสดงการมีอยู่ของไวรัสในปริมาณที่น้อย

ตรวจไม่พบค่า CoV ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 จากม้ามและไต ซึ่งบ่งชี้ว่าสัตว์ไม่ได้ติดเชื้อตามธรรมชาติ แต่ลำดับที่ได้มาในห้องปฏิบัติการระหว่างการประมวลผลตัวอย่างอวัยวะ การศึกษาในปัจจุบันสรุปว่าลิ่นไม่น่าจะเป็นโฮสต์ของเบต้าโคโรนาไวรัสระดับกลาง

ข้อสรุปการระบุ CoV ใหม่นี้ใช้ชุดข้อมูล RNA-Seq เซลล์เดียวที่ได้จากลิ่นตัวเดียวที่ตายด้วยสาเหตุตามธรรมชาติ HKU4-BGI-2020 เป็นตัวแทนของ CoV ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 ลำดับที่สี่ซึ่งถูกกำหนดให้เป็น “clade b” ที่เพิ่งระบุใหม่ clade นี้มีความแตกต่างทางสายวิวัฒนาการจาก CoVs ที่เกี่ยวข้องกับ HKU4 ที่รู้จัก MjHKU4r-CoV-2 และ MjHKU4rCoV-4 ถูกกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่ใกล้เคียงของไอโซเลทนี้